Vilniaus miesto savivaldybės choras „Jauna muzika“ sukaupė įvairų ir vertingą repertuarą, kuris apima visų epochų meistrų partitūras chorui a cappella, vokalinės-instrumentinės muzikos šedevrus ir premjeras.

Choras yra parengęs pasaulietinių bei sakralinių Johanno Sebastiano Bacho kūrinių, Georgo Friedricho Händelio oratoriją „Judas Makabėjus“, Antonio Vivaldi Gloria, Josepho Haydno oratorijas „Pasaulio sutvėrimas“, „Metų laikai“, Gabrielio Fauré Requiem, įspūdingą Carlo Orffo oratorijos „Carmina Burana“ atlikimą, naujausios britų chorinės muzikos (Johno Tavenerio, Tariko O’Regano, Gabrielio Jacksono, Howardo Skemptono ir kt.), tradicinių gospelų ir spiričiuelių (aran. Hallo Johnsono, Steve’o Dobrogoszo, Henry’o Smitho, Moses Hogano, Jimo Raycrofto, Bobo Chilcotto), XVI-XVII a. Venecijos ir flamandų didžiųjų polifonijos meistrų (Orlandus Lassus, Luca Marenzio, Orazio Benevoli, Nicholas Gombert, Giovani Gabrieli ir kt.) muzikos programas, kalėdiniu metu ne kartą buvo atliktos Johno Rutterio giesmės bei Benjamino Britteno „Ceremony of Carols“, o 2010 m. tarptautiniame šiuolaikinės muzikos festivalyje „Gaida“ choras atliko Gérard Grisey „Les chants de l’amour“, reikalaujančias ypatingos precizikos ir aukšto meistriškumo lygio.

Ypatingą dėmesį choras teikia šiandienos lietuvių kompozitorių chorinės kūrybos premjeroms, atlikimui ir sklaidai. Choro repertuare – pasaulinio pripažinimo sulaukusių Algirdo Martinaičio, Mindaugo Urbaičio, Vaclovo Augustino, Broniaus Kutavičiaus, Vytauto Miškinio, Giedriaus Svilainio, Vidmanto Bartulio ir kt. kompozicijos. Nuo 2007 m. choras kartu su kitais partneriais organizuoja jaunųjų kompozitorių chorinės muzikos konkursą-koncertą „Vox Juventutis“, kurio siekis – plėsti chorinės muzikos repertuarą ir populiarumą.